46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_R0047 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 
112 bp  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0009  tRNA-Pro  96.43 
 
 
112 bp  190  5e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.149139  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0019  tRNA-Gln  100 
 
 
73 bp  65.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0021  tRNA-Gln  100 
 
 
73 bp  65.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0028  tRNA-Asp  100 
 
 
78 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00270528  hitchhiker  0.000366483 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0038  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.266869  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 
93 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 
113 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 
72 bp  46.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.905442  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0044  tRNA-Thr  100 
 
 
93 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0044  tRNA-OTHER  100 
 
 
109 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.335529  normal 
 
 
-
 
NC_010525  TNEU_1  tRNA-OTHER  100 
 
 
108 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.329666  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 
109 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0012  tRNA-Asp  100 
 
 
112 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 
74 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10375  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0023  tRNA-OTHER  100 
 
 
109 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0777816  normal  0.377314 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0039  tRNA-OTHER  100 
 
 
95 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0039  tRNA-Thr  100 
 
 
92 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0474661 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0009  tRNA-OTHER  100 
 
 
109 bp  46.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.146506  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 
101 bp  46.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.35465  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0004  tRNA-Glu  93.33 
 
 
78 bp  44.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.759432  normal 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  93.33 
 
 
80 bp  44.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0006  tRNA-Glu  93.33 
 
 
80 bp  44.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 
75 bp  44.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.794494  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0018  tRNA-OTHER  93.33 
 
 
98 bp  44.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.352421  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  44.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65986  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0042  tRNA-OTHER  100 
 
 
96 bp  44.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0040  tRNA-Asp  93.33 
 
 
78 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 
75 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.805604 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0002  tRNA-Gln  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.837764  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0006  tRNA-Glu  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76195  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 
95 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0043  tRNA-OTHER  93.33 
 
 
68 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0034  tRNA-Met  93.33 
 
 
99 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0029  tRNA-OTHER  93.33 
 
 
73 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000033077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0112576 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0464601  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0036  tRNA-OTHER  100 
 
 
108 bp  44.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0021  tRNA-Gln  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 
98 bp  44.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.06804  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0005  tRNA-Pro  100 
 
 
104 bp  44.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>