55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_R0009 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_R0009  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  216  9e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.146506  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0011  tRNA-Gly  90 
 
 		 95 bp  63.9  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0028  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  60  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00270528  hitchhiker  0.000366483 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  54  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.905442  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0037  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 97 bp  54  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0026  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 97 bp  54  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0018  tRNA-OTHER  96.67 
 
 		 98 bp  52  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.352421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0043  tRNA-OTHER  96.67 
 
 		 68 bp  52  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0040  tRNA-Asp  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0012  tRNA-Asp  100 
 
 		 112 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  TNEU_1  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0044  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.335529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0044  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 		 101 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.35465  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0039  tRNA-OTHER  100 
 
 		 95 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0038  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.266869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0023  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0777816  normal  0.377314 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0039  tRNA-Thr  100 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0474661 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0036  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0011  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.759432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t15  tRNA-Asp  96.43 
 
 		 128 bp  48.1  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.150704  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0015  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.794494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0022  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112576 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0025  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0042  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 96 bp  48.1  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0040  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 		 112 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0019  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0021  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0009  tRNA-Pro  100 
 
 		 112 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.149139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0033  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0049  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.880915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0032  tRNA-His  96.3 
 
 		 79 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.622503  normal  0.311828 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 80 bp  44.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0006  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 80 bp  44.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0004  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.805604 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0006  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0034  tRNA-Met  96.15 
 
 		 99 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0029  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000033077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0464601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0036  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  44.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 98 bp  44.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.06804  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0005  tRNA-Pro  100 
 
 		 104 bp  44.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0066  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306827  normal  0.744796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0063  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0323574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0050  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.559947  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>