11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0063 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0063  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0323574  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0066  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306827  normal  0.744796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0050  tRNA-Gly  98.61 
 
 
72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.559947  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0006  tRNA-Gly  94.12 
 
 
72 bp  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0051  tRNA-Gly  87.72 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.9415 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0030  tRNA-Gly  87.5 
 
 
72 bp  56  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0018  tRNA-Gly  85.96 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0230134  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0048  tRNA-Gly  85.96 
 
 
72 bp  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0040  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0033  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0009  tRNA-OTHER  100 
 
 
109 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.146506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>