22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_R0033 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_R0033  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0040  tRNA-Gly  96.92 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0003  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0439445  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0002  tRNA-Gly  88.46 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0018  tRNA-Gly  86.21 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232817  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0013  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0026  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0009  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.146506  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0025  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 108 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0031  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0037  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362348  normal  0.882649 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0029  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0015  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123591 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0020  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000277692 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0037  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 97 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0026  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 97 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0066  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306827  normal  0.744796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0063  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0323574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0050  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.559947  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>