14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0051 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0051  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.9415 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0018  tRNA-Gly  97.01 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0230134  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0048  tRNA-Gly  97.01 
 
 
72 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0007  tRNA-Gly  96.72 
 
 
72 bp  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0036  tRNA-Gly  96.72 
 
 
72 bp  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.94403 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0030  tRNA-Gly  94.03 
 
 
72 bp  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0020  tRNA-Gly  94.03 
 
 
72 bp  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0050  tRNA-Gly  87.72 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.559947  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0063  tRNA-Gly  87.72 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0323574  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0066  tRNA-Gly  87.72 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306827  normal  0.744796 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0006  tRNA-Gly  85.71 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0041  tRNA-Gly  96.43 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0015  tRNA-OTHER  100 
 
 
86 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00401189  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0001  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0096405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>