10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0041 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0041  tRNA-Gly  100 
 
 
89 bp  176  6e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0009  tRNA-Gly  97.14 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0015  tRNA-OTHER  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00401189  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0018  tRNA-Gly  96.77 
 
 
75 bp  54  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0230134  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0051  tRNA-Gly  96.43 
 
 
72 bp  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.9415 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0053  tRNA-Gly  90 
 
 
72 bp  48.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.138772  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0048  tRNA-Gly  96.43 
 
 
72 bp  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00620  tRNA-Glu  100 
 
 
93 bp  46.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06450  tRNA-Glu  100 
 
 
93 bp  46.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.990683  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04820  tRNA-Glu  100 
 
 
93 bp  46.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.59741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>