14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0009 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0009  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0053  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.138772  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0041  tRNA-Gly  97.14 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0050  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0015  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.94366  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0021  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0004  tRNA-Gly  87.1 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.901612 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0032  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22235  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0059  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.507102  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0023  tRNA-Gly  88.37 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.135769  normal  0.832903 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0049  tRNA-Gly  88.37 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.151378 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0025  tRNA-Gly  88.37 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0050  tRNA-Gly  88.37 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0938912  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0011  tRNA-Gly  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>