21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0050 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0050  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0015  tRNA-Gly  98.59 
 
 		 71 bp  133  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.94366  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0004  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 71 bp  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.901612 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0021  tRNA-Gly  95.45 
 
 		 71 bp  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0059  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.507102  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0009  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0050  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0938912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0025  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0018  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0843457 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0037  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.493673 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0047  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0049  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.151378 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0004  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0010  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.248969  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0013  tRNA-Gly  86.21 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0010  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.043845  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0009  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0405539  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0023  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.135769  normal  0.832903 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0018  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232817  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0053  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.138772  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0032  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>