22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0018 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232817  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0013  tRNA-Gly  98.41 
 
 		 71 bp  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0018  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0843457 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0023  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.135769  normal  0.832903 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0037  tRNA-Gly  94.64 
 
 		 71 bp  87.7  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.493673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0049  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.151378 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0045  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.485198  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0050  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 71 bp  71.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0938912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0025  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 71 bp  71.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0003  tRNA-Gly  90.7 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0439445  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0002  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0033  tRNA-Gly  86.21 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0070  tRNA-Gly  88.64 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0869039  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0050  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0034  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0037  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362348  normal  0.882649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0025  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.896099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.94366  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0018  tRNA-Gly  85.19 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.881982  normal  0.183474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>