13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0059 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0059  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.507102  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0021  tRNA-Gly  95.45 
 
 
71 bp  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0050  tRNA-Gly  91.55 
 
 
71 bp  93.7  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0004  tRNA-Gly  91.55 
 
 
71 bp  93.7  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.901612 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0015  tRNA-Gly  90.14 
 
 
71 bp  85.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.94366  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0010  tRNA-Gly  91.49 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.248969  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0004  tRNA-Gly  91.49 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0047  tRNA-Gly  91.49 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0009  tRNA-Gly  93.48 
 
 
73 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0405539  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0010  tRNA-Gly  93.48 
 
 
73 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.043845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0009  tRNA-Gly  85.71 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0007  tRNA-Gly  87.23 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.88644  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>