14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0021 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0021  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0059  tRNA-Gly  95.45 
 
 
71 bp  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.507102  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0050  tRNA-Gly  95.45 
 
 
71 bp  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0004  tRNA-Gly  95.45 
 
 
71 bp  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.901612 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0015  tRNA-Gly  93.94 
 
 
71 bp  99.6  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.94366  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0009  tRNA-Gly  87.5 
 
 
72 bp  56  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0037  tRNA-Gly  92.11 
 
 
71 bp  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.493673 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0009  tRNA-Gly  88.89 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0405539  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0010  tRNA-Gly  88.89 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.043845  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0010  tRNA-Gly  89.47 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.248969  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0004  tRNA-Gly  89.47 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0047  tRNA-Gly  89.47 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0057  tRNA-Gly  91.18 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0018  tRNA-Gly  93.33 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0843457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>