10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_R0010 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_R0010  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.248969  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0047  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0007  tRNA-Gly  97.26 
 
 
73 bp  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.88644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0009  tRNA-Gly  89.04 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0405539  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0010  tRNA-Gly  89.04 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.043845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0059  tRNA-Gly  91.49 
 
 
71 bp  61.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.507102  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0050  tRNA-Gly  89.36 
 
 
71 bp  54  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0015  tRNA-Gly  90 
 
 
71 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.94366  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0021  tRNA-Gly  89.47 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>