15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_R0018 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0843457 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0037  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  127  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.493673 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0018  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232817  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0013  tRNA-Gly  94.64 
 
 		 71 bp  87.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0023  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.135769  normal  0.832903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0050  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0015  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.94366  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0049  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.151378 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0025  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0050  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0938912  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0021  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0045  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.485198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>