59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0023 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0023  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.135769  normal  0.832903 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0049  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.151378 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0050  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0938912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0018  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0045  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.485198  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0013  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0018  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0843457 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0034  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000457466  normal  0.978086 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0032  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22235  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0037  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.493673 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0050  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0009  tRNA-Gly  88.37 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0032  tRNA-His  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.622503  normal  0.311828 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00454198  hitchhiker  6.07507e-16 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0031  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.137848  normal  0.0108409 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0025  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0019  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0308223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0006  tRNA-Glu  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0018  tRNA-OTHER  100 
 
 		 98 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.352421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0019  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.661812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0029  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0033  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 109 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0030  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.290488  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t15  tRNA-Asp  100 
 
 		 128 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.150704  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t40  tRNA-Glu  100 
 
 		 130 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_9  tRNA-Cys  100 
 
 		 111 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0024  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.897689  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0035  tRNA-Thr  100 
 
 		 101 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0006  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0014  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 80 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0015  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 81 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.321152 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0017  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544015  hitchhiker  0.0000175042 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0029  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000033077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0034  tRNA-Met  100 
 
 		 99 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0042  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0043  tRNA-OTHER  100 
 
 		 68 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309292  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0007  tRNA-Met  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000654684  hitchhiker  0.0000516648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0003  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 112 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0021  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0006  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.5604 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 101 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.329697  hitchhiker  0.00107888 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  100 
 
 		 96 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0040  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_1  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0017  tRNA-Ala  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0717588  decreased coverage  0.00491532 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0669061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.355045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0004  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>