10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0032 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0032  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22235  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0053  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.138772  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0009  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0050  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0015  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.94366  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0023  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.135769  normal  0.832903 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0049  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.151378 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0025  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0050  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0938912  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0018  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 71 bp  44.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.881982  normal  0.183474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>