25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_R0049 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_R0049  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.151378 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0023  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.135769  normal  0.832903 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0050  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0938912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0013  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 71 bp  79.8  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0018  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0045  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.485198  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0034  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000457466  normal  0.978086 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0050  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0015  tRNA-OTHER  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0958648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0018  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0843457 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0037  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.493673 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0009  tRNA-Gly  88.37 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0015  tRNA-Gly  84.75 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.94366  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0032  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22235  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0033  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 109 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0019  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.661812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0021  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0003  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 112 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309292  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0042  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0015  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 81 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.321152 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0014  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 80 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0006  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>