12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0015 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0015  tRNA-OTHER  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0958648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0039  tRNA-OTHER  89.66 
 
 		 92 bp  67.9  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.147165  hitchhiker  0.000226333 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0040  tRNA-Glu  84.62 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0004  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0019  tRNA-Glu  94.29 
 
 		 78 bp  54  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000398657 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0029  tRNA-Glu  83.33 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0006  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0006  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 80 bp  50.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0049  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  50.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.151378 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0040  tRNA-Asp  88.64 
 
 		 78 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0050  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0938912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>