56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0029 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_R0029  tRNA-Glu  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0040  tRNA-Glu  98.89 
 
 
90 bp  170  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0039  tRNA-OTHER  100 
 
 
92 bp  97.6  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.147165  hitchhiker  0.000226333 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0006  tRNA-Glu  95.92 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76195  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0006  tRNA-Glu  95.92 
 
 
80 bp  81.8  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  97.78 
 
 
80 bp  81.8  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  97.78 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  97.78 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0004  tRNA-Glu  95.92 
 
 
78 bp  81.8  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0040  tRNA-Asp  97.73 
 
 
78 bp  79.8  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0018  tRNA-OTHER  97.62 
 
 
98 bp  75.8  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.352421  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0043  tRNA-OTHER  97.62 
 
 
68 bp  75.8  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0029  tRNA-OTHER  97.56 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000033077 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0014  tRNA-Asp  95.45 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0034  tRNA-Met  97.37 
 
 
99 bp  67.9  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0005  tRNA-Asp  93.18 
 
 
78 bp  63.9  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.280636 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0028  tRNA-Asp  93.18 
 
 
78 bp  63.9  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00270528  hitchhiker  0.000366483 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t40  tRNA-Glu  100 
 
 
130 bp  60  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0032  tRNA-His  92.86 
 
 
79 bp  60  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.622503  normal  0.311828 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0019  tRNA-Glu  90.91 
 
 
75 bp  56  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0046  tRNA-Glu  90.91 
 
 
75 bp  56  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t15  tRNA-Asp  96.67 
 
 
128 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.150704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0015  tRNA-OTHER  83.33 
 
 
90 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0958648  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0016  tRNA-Glu  90.48 
 
 
75 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0030  tRNA-Glu  90.48 
 
 
75 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  50.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 
90 bp  50.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00032499  normal  0.0128172 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0021  tRNA-Gln  88.64 
 
 
73 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0012  tRNA-Gly  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0014  tRNA-His  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0002  tRNA-His  96.43 
 
 
72 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.162169  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0003  tRNA-OTHER  100 
 
 
112 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0016  tRNA-His  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.036112 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0016  tRNA-Glu  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0045  tRNA-Glu  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.556682  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0030  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.290488  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0019  tRNA-Glu  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000144423 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0034  tRNA-Glu  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0042  tRNA-Glu  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0007  tRNA-Glu  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0019  tRNA-OTHER  100 
 
 
95 bp  44.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.661812  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0042  tRNA-OTHER  100 
 
 
95 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0007  tRNA-Met  96.15 
 
 
78 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000654684  hitchhiker  0.0000516648 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0043  tRNA-Met  96.15 
 
 
94 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.571582  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0015  tRNA-Glu  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0154523  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0043  tRNA-Glu  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0040  tRNA-Glu  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0033  tRNA-OTHER  100 
 
 
109 bp  44.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0019  tRNA-Phe  96.15 
 
 
109 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0015  tRNA-OTHER  100 
 
 
81 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.321152 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 
94 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0006  tRNA-Gly  100 
 
 
92 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138313  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0019  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  44.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000398657 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0031  tRNA-Ser  96.15 
 
 
89 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.137848  normal  0.0108409 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0014  tRNA-OTHER  100 
 
 
80 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>