20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0019 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0019  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000398657 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0015  tRNA-OTHER  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0958648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  NMAR_1  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 94 bp  50.1  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000407727 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000144423 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t55  tRNA-His  100 
 
 		 122 bp  44.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t40  tRNA-Glu  100 
 
 		 130 bp  44.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0018  tRNA-OTHER  100 
 
 		 98 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.352421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0006  tRNA-Glu  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0004  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0029  tRNA-Glu  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0039  tRNA-OTHER  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.147165  hitchhiker  0.000226333 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0040  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0006  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0043  tRNA-OTHER  100 
 
 		 68 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0034  tRNA-Met  100 
 
 		 99 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0029  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000033077 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0040  tRNA-Glu  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>