8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ABOO_t55 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  ABOO_t55  tRNA-His  100 
 
 		 122 bp  242  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t5  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 126 bp  58  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t30  tRNA-Ile  91.67 
 
 		 124 bp  48.1  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0033  tRNA-His  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0002  tRNA-His  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.162169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0016  tRNA-His  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.036112 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000144423 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0019  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000398657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>