18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0018 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000144423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0040  tRNA-Glu  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t40  tRNA-Glu  100 
 
 
130 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0018  tRNA-OTHER  100 
 
 
98 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.352421  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0006  tRNA-Glu  100 
 
 
80 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 
80 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0019  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000398657 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0004  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0039  tRNA-OTHER  100 
 
 
92 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.147165  hitchhiker  0.000226333 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0040  tRNA-Asp  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0006  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76195  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0043  tRNA-OTHER  100 
 
 
68 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0034  tRNA-Met  100 
 
 
99 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0029  tRNA-OTHER  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000033077 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0029  tRNA-Glu  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t55  tRNA-His  100 
 
 
122 bp  44.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>