57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0039 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0039  tRNA-OTHER  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.147165  hitchhiker  0.000226333 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0029  tRNA-Glu  100 
 
 		 90 bp  97.6  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0040  tRNA-Glu  97.96 
 
 		 90 bp  89.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0004  tRNA-Glu  96.23 
 
 		 78 bp  89.7  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0040  tRNA-Asp  97.87 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0006  tRNA-Glu  96 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  97.83 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  97.83 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0006  tRNA-Glu  95.92 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  97.78 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0018  tRNA-OTHER  97.62 
 
 		 98 bp  75.8  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.352421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0029  tRNA-OTHER  97.62 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000033077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0043  tRNA-OTHER  97.62 
 
 		 68 bp  75.8  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0014  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0034  tRNA-Met  97.44 
 
 		 99 bp  69.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0015  tRNA-OTHER  89.66 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0958648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0005  tRNA-Asp  93.18 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.280636 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0028  tRNA-Asp  93.18 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00270528  hitchhiker  0.000366483 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0032  tRNA-His  92.86 
 
 		 79 bp  60  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.622503  normal  0.311828 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t40  tRNA-Glu  100 
 
 		 130 bp  60  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0019  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0046  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t15  tRNA-Asp  96.67 
 
 		 128 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.150704  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0016  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0030  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00032499  normal  0.0128172 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0016  tRNA-His  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.036112 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0012  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0014  tRNA-His  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0002  tRNA-His  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.162169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0003  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0021  tRNA-Gln  88.64 
 
 		 73 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0016  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0030  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.290488  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0045  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.556682  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0033  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0019  tRNA-Phe  96.3 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0019  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000144423 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0007  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0042  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0014  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0034  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0006  tRNA-Gly  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0019  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000398657 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0031  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.137848  normal  0.0108409 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0019  tRNA-OTHER  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.661812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0015  tRNA-OTHER  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.321152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0027  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.102213  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0040  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0043  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0015  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0154523  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0007  tRNA-Met  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000654684  hitchhiker  0.0000516648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0042  tRNA-OTHER  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0043  tRNA-Met  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.571582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>