24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0005 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0005  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.280636 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0014  tRNA-Asp  98.25 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0006  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0040  tRNA-Asp  90.14 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0028  tRNA-Asp  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00270528  hitchhiker  0.000366483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0018  tRNA-OTHER  93.62 
 
 		 98 bp  69.9  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.352421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0043  tRNA-OTHER  93.62 
 
 		 68 bp  69.9  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0006  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 80 bp  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 80 bp  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.087724 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0029  tRNA-Glu  93.18 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0004  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0039  tRNA-OTHER  93.18 
 
 		 92 bp  63.9  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.147165  hitchhiker  0.000226333 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0040  tRNA-Glu  93.18 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0034  tRNA-Met  94.59 
 
 		 99 bp  58  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0012  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0029  tRNA-OTHER  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000033077 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0032  tRNA-His  92.11 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.622503  normal  0.311828 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0014  tRNA-His  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0016  tRNA-His  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.036112 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0002  tRNA-His  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.162169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t40  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 130 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>