43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_R0032 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_R0032  tRNA-His  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.622503  normal  0.311828 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0018  tRNA-OTHER  95.65 
 
 		 98 bp  75.8  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.352421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0040  tRNA-Asp  95.65 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0043  tRNA-OTHER  95.65 
 
 		 68 bp  75.8  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0006  tRNA-Glu  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0006  tRNA-Glu  93.48 
 
 		 80 bp  67.9  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0004  tRNA-Glu  93.48 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  93.18 
 
 		 80 bp  63.9  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0029  tRNA-OTHER  97.14 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000033077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0034  tRNA-Met  97.14 
 
 		 99 bp  61.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0028  tRNA-Asp  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00270528  hitchhiker  0.000366483 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0039  tRNA-OTHER  92.86 
 
 		 92 bp  60  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.147165  hitchhiker  0.000226333 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0040  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 90 bp  60  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0029  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 90 bp  60  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0014  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t40  tRNA-Glu  96.77 
 
 		 130 bp  54  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t15  tRNA-Asp  100 
 
 		 128 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.150704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0005  tRNA-Asp  92.11 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.280636 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.5604 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0035  tRNA-Thr  100 
 
 		 101 bp  50.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0019  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0308223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0007  tRNA-Met  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000654684  hitchhiker  0.0000516648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_9  tRNA-Cys  100 
 
 		 111 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  100 
 
 		 96 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0030  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.290488  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0009  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.146506  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.355045  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0027  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.658502  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0003  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0023  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.135769  normal  0.832903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0012  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0024  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.897689  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0028  tRNA-His  96.15 
 
 		 103 bp  44.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  MSED_1  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0017  tRNA-Ala  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0717588  decreased coverage  0.00491532 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0021  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.905442  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0019  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.186619  normal  0.0165444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>