24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_R0016 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_R0034  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0007  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0042  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0019  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0045  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.556682  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0016  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0030  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0016  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0019  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0046  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0067  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.772676  normal  0.0107371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0068  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.544619  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0042  tRNA-Glu  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.835093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0046  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0027  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.024041 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0004  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0039  tRNA-OTHER  91.43 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.147165  hitchhiker  0.000226333 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0029  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  91.43 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0029  tRNA-OTHER  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000033077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0050  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.259835 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0048  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.200275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>