15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_R0004 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_R0004  tRNA-OTHER  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0050  tRNA-OTHER  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0718126  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0014  tRNA-OTHER  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0047  tRNA-OTHER  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.335108 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0002  tRNA-OTHER  87.5 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332462  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0019  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0045  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.556682  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0019  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0046  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0016  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0030  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0016  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0042  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0007  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0034  tRNA-Glu  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>