48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_R0016 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_R0016  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0030  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0046  tRNA-Glu  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0019  tRNA-Glu  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0042  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0007  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0045  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.556682  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0034  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0016  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0019  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0068  tRNA-Glu  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.544619  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0067  tRNA-Glu  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.772676  normal  0.0107371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0027  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.024041 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0017  tRNA-Glu  89.58 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0017  tRNA-Glu  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000000132738  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0010  tRNA-Glu  84 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0032  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 111 bp  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0015  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0154523  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0046  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0040  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0043  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0029  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0039  tRNA-OTHER  90.48 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.147165  hitchhiker  0.000226333 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  91.89 
 
 		 80 bp  50.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0017  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0035  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0042  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.835093  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0016  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0004  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0010  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.330224  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0040  tRNA-Glu  88.1 
 
 		 90 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0029  tRNA-OTHER  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000033077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0050  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.259835 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0022  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0421287  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0006  tRNA-Glu  88.1 
 
 		 80 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0024  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0232255  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0012  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.326071  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0004  tRNA-Glu  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0006  tRNA-Glu  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0040  tRNA-Asp  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0039  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0037  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0040  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0037  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0033  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0035  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>