13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_R0010 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_R0010  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0067  tRNA-Glu  96.15 
 
 
78 bp  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.772676  normal  0.0107371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0068  tRNA-Glu  96.15 
 
 
78 bp  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.544619  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0017  tRNA-Glu  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000000132738  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0019  tRNA-Glu  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0046  tRNA-Glu  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0016  tRNA-Glu  84 
 
 
75 bp  54  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0030  tRNA-Glu  84 
 
 
75 bp  54  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0043  tRNA-Glu  90.7 
 
 
75 bp  54  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0015  tRNA-Glu  90.7 
 
 
75 bp  54  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0154523  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0042  tRNA-Glu  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.835093  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0017  tRNA-Glu  84.48 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0016  tRNA-Glu  84.48 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.510294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>