25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0043 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_R0043  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0015  tRNA-Glu  97.33 
 
 
75 bp  133  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0154523  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0046  tRNA-Glu  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0040  tRNA-Glu  93.22 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0067  tRNA-Glu  88 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.772676  normal  0.0107371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0068  tRNA-Glu  88 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.544619  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0019  tRNA-Glu  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0046  tRNA-Glu  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0048  tRNA-Glu  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0017  tRNA-Glu  86.15 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000000132738  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0032  tRNA-Glu  92.68 
 
 
111 bp  58  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0016  tRNA-Glu  87.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0050  tRNA-Glu  85.29 
 
 
75 bp  56  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.259835 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0017  tRNA-Glu  87.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0048  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  56  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.200275 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0010  tRNA-Glu  90.7 
 
 
78 bp  54  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0016  tRNA-Glu  86.21 
 
 
75 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0030  tRNA-Glu  86.21 
 
 
75 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0011  tRNA-Glu  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0580345  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0042  tRNA-Glu  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.835093  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0029  tRNA-Glu  91.18 
 
 
90 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  91.18 
 
 
80 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0039  tRNA-OTHER  91.18 
 
 
92 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.147165  hitchhiker  0.000226333 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>