14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0017 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0017  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000000132738  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0067  tRNA-Glu  93.33 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.772676  normal  0.0107371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0068  tRNA-Glu  93.33 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.544619  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0010  tRNA-Glu  89.33 
 
 
78 bp  85.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0019  tRNA-Glu  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0046  tRNA-Glu  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0043  tRNA-Glu  86.15 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0015  tRNA-Glu  86.15 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0154523  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0016  tRNA-Glu  84 
 
 
75 bp  54  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0030  tRNA-Glu  84 
 
 
75 bp  54  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0019  tRNA-Gln  93.75 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0039  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00479691  normal  0.0244007 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0017  tRNA-Glu  86.96 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0046  tRNA-Glu  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
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