26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0017 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0017  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0052  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.914226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0017  tRNA-Glu  90.67 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0036  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0027  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.024041 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0016  tRNA-Glu  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0016  tRNA-Glu  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0206825  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25080  tRNA-Glu  97.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0038  tRNA-Glu  97.3 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000513604  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0023  tRNA-Glu  97.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0002  tRNA-Glu  97.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240355  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0007  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0016  tRNA-Glu  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0052  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0030  tRNA-Glu  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0067  tRNA-Glu  89.58 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.772676  normal  0.0107371 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0046  tRNA-Glu  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0019  tRNA-Glu  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0035  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0068  tRNA-Glu  89.58 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.544619  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01850  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06180  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.75789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0058  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0067  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0012187  normal  0.0113545 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0066  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000000461101  hitchhiker  0.000137372 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0017  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000000132738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>