66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0036 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0036  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0017  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0016  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0052  tRNA-Glu  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.914226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0017  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0067  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0012187  normal  0.0113545 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0066  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000000461101  hitchhiker  0.000137372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0052  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0027  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.024041 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0081  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000557933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0041  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000265789  hitchhiker  0.00179079 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0050  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0011  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0070  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0071  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0052  tRNA-Asp  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0028  tRNA-Asp  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926195  normal  0.035685 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0035  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1507  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0058  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0027  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0395147  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0033  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84722 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0002  tRNA-Glu  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240355  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0023  tRNA-Glu  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25080  tRNA-Glu  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0045  tRNA-Glu  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0333401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0047  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0052  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0054  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0019  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481461  hitchhiker  0.000000177152 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0044  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0009  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.39439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0012  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188086  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0035  tRNA-Glu  84 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0068  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0038  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000513604  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0007  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGluVIMSS1309378  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0039  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0041  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGluVIMSS1309151  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0730688  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGluVIMSS1309264  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128341 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGluVIMSS1309208  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.689492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGluVIMSS1309126  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGluVIMSS1309075  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0011  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.267714  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0010  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.644532  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0007  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183145  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0024  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2830  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000136674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2833  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000102319  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2832  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2831  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000125741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2828  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000743233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2829  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14015  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00298492  normal  0.41958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18170  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251001  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23850  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11600  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.589046 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1165  hypothetical protein  100 
 
 		 396 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.360814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0030  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0049  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>