More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_R0010 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_tRNAGluVIMSS1309378  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0010  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.644532  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0011  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.267714  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0024  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGluVIMSS1309208  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.689492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGluVIMSS1309151  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0730688  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGluVIMSS1309126  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGluVIMSS1309075  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGluVIMSS1309264  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128341 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0041  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0007  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183145  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0005  tRNA-Glu  97.06 
 
 		 73 bp  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.601748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0045  tRNA-Glu  97.06 
 
 		 76 bp  119  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0333401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0034  tRNA-Glu  95.59 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0633103 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0033  tRNA-Glu  95.59 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.752576  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0031  tRNA-Glu  95.59 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  94.29 
 
 		 76 bp  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0038  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000255678  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0104  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0156595  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0043  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0177795  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0041  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00117602  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0109  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000218236  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0074  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000046104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0084  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000679544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0080  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0045  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0637715  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0039  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00037327  normal  0.202032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0105  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00614062  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0037  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000218875  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0026  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.062518  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0112  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000133655  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0107  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000800157  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0106  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00248374  normal  0.1959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0036  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000509558  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0077  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000145614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000364712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0110  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000208441  normal  0.204301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0108  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000221581  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0113  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000136278  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0111  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000137608  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0073  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000527545  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0076  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0075  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000263239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0072  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000259101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0079  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0081  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000920417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0082  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0078  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000635495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0083  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000720512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0042  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353157  normal  0.196649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0040  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115197  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0046  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113543  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0044  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369113  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0045  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 73 bp  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0742586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0026  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.307498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0186  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0022  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0057  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000756674  normal  0.548722 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2009  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0059  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000917431  normal  0.553022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0055  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101693  normal  0.730333 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0022  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.777286  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01850  tRNA-Glu  93.75 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0007  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.466736 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0043  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0945053  normal  0.0751648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0059  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.935915 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0106  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.608719  normal  0.0144699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0030  tRNA-Glu  92.75 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0030  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032688  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0039  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0081  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000080757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0087  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0089  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000367651  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2829  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2830  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000136674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2831  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000125741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2832  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4194  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000043379  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0043  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  7.66398e-18  hitchhiker  0.000611065 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0053  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.646689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0046  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118448  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0049  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000939786  normal  0.015549 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4284  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0086  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4190  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00029698  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0090  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0045  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000328054  normal  0.0346347 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0055  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380229  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4216  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133179  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0063  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000754963  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0065  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126201  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0066  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122545  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0067  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000119712  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0074  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000020686  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0018  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0095  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000290046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0096  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000128006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>