28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0052 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0052  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.914226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0017  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0017  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0016  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0206825  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0036  tRNA-Glu  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0016  tRNA-Glu  91.94 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0027  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.024041 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0035  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0028  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926195  normal  0.035685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0052  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0052  tRNA-Glu  90 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0019  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481461  hitchhiker  0.000000177152 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0052  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0011  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.638605 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0032  tRNA-Asp  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0033  tRNA-Glu  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0058  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0067  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0012187  normal  0.0113545 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0066  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000000461101  hitchhiker  0.000137372 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0002  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240355  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0023  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0038  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000513604  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25080  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0022  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.845779 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0031  tRNA-Asp  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0045  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0700385  normal  0.136088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>