299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_R0023 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_R0023  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0002  tRNA-Glu  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240355  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0038  tRNA-Glu  96.88 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000513604  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0007  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0052  tRNA-Glu  93.65 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25080  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0022  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150409  hitchhiker  0.00052092 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0058  tRNA-Glu  92.06 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0009  tRNA-Glu  92.06 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.39439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0068  tRNA-Glu  92.06 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0002  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9841800000000004e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0004  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.0060400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01850  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0005  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334016 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0012  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188086  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0006  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0083  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0027  tRNA-Glu  94 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0066  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000000461101  hitchhiker  0.000137372 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0067  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0012187  normal  0.0113545 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  88 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06180  tRNA-Glu  88.57 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.75789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0045  tRNA-Glu  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0333401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0019  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481461  hitchhiker  0.000000177152 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0003  tRNA-Glu  88.57 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0033  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000100109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0058  tRNA-Glu  88.71 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000216318  unclonable  0.00000608893 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0011  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0017  tRNA-Glu  97.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0007  tRNA-Glu  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866877  hitchhiker  0.000537745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0019  tRNA-Glu  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00210704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0030  tRNA-Glu  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000166149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0043  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000194529  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0026  tRNA-Glu  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.307498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0070  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0026  tRNA-Glu  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.062518  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0071  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0035  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0027  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0395147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0060  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0062  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.427189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0073  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122023  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0097  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000640462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0064  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0099  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000545128  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0044  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0041  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119319  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0052  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.699751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0045  tRNA-Glu  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502563  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1796  tRNA-Glu  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0043  tRNA-Glu  86.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0981603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0030  tRNA-Glu  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2294100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0092  tRNA-Glu  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000633389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0082  tRNA-Glu  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000179786  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0001  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0096405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0022  tRNA-Glu  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.845779 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2829  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2830  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000136674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2832  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t066  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t067  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t068  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t069  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0076  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGluVIMSS1309151  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0730688  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0081  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000080757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0080  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000593448  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0042  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260023  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0043  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0041  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000984885  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0078  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00140572  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0007  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183145  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0016  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000647027  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0095  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000187463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0097  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00001173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0098  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00699861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0099  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0236458  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0100  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0345698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0101  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0318597  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0014  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178243  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000364712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0063  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000754963  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0065  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126201  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0066  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122545  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0067  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000119712  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0068  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000101886  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0069  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000616599  normal  0.0122631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0070  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000026178  normal  0.0123268 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0067  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000450413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0068  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000473191  normal  0.85687 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0088  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00276432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0090  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0092  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000105241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0094  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000925295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0095  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000290046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0096  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0097  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000012419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>