69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_R0058 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_R0058  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000216318  unclonable  0.00000608893 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0015  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000362214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0009  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.250307  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0058  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0015  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.679180000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0067  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000153878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0052  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393318  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0052  tRNA-Glu  91.03 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0047  tRNA-Glu  91.03 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0052  tRNA-Glu  91.03 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0054  tRNA-Glu  91.03 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0002  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0049  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000824849  hitchhiker  0.0000000000360251 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0012  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0011  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0038  tRNA-Glu  87.18 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000513604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0068  tRNA-Glu  87.18 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0009  tRNA-Glu  87.18 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.39439  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0070  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0019  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481461  hitchhiker  0.000000177152 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0035  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0027  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0395147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0007  tRNA-Glu  90 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0071  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25080  tRNA-Glu  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0023  tRNA-Glu  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0022  tRNA-Glu  85.9 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150409  hitchhiker  0.00052092 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0052  tRNA-Glu  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.699751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00679153  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0037  tRNA-Glu  87.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06180  tRNA-Glu  86.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.75789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0084  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0027  tRNA-Glu  84.62 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.624035  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1163  tRNA-Glu  87.04 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.77096  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18590  tRNA-Glu  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.2903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18600  tRNA-Glu  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204503  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0030  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0030  tRNA-Glu  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0003  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0008  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.137001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0043  tRNA-Glu  84.21 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000194529  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0006  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766786  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0060  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0045  tRNA-Glu  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0333401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000364712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0004  tRNA-Glu  87.23 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.0060400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0002  tRNA-Glu  87.23 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9841800000000004e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1507  tRNA-Glu  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1357  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0019  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00210704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0030  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000166149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0056  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0005  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334016 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0066  tRNA-Glu  84 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000000461101  hitchhiker  0.000137372 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0067  tRNA-Glu  84 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0012187  normal  0.0113545 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0050  tRNA-Glu  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0007  tRNA-Glu  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.466736 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0043  tRNA-Glu  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0945053  normal  0.0751648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0059  tRNA-Glu  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.935915 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0106  tRNA-Glu  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.608719  normal  0.0144699 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0044  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0035  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000239381  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0003  tRNA-Glu  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>