299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_R0083 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_R0083  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0060  tRNA-Glu  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01850  tRNA-Glu  95.77 
 
 		 73 bp  117  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0005  tRNA-Glu  95.77 
 
 		 73 bp  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0006  tRNA-Glu  95.77 
 
 		 73 bp  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766786  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0041  tRNA-Glu  96.97 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119319  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0014  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0046  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0062  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.427189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  94.37 
 
 		 73 bp  109  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  94.37 
 
 		 73 bp  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0015  tRNA-Glu  94.37 
 
 		 73 bp  109  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0003  tRNA-Glu  95.65 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0045  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0333401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0043  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0981603  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0015  tRNA-Glu  92.96 
 
 		 73 bp  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0072  tRNA-Glu  92.96 
 
 		 73 bp  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.514054 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0054  tRNA-Glu  92.96 
 
 		 73 bp  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25080  tRNA-Glu  92.96 
 
 		 73 bp  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0052  tRNA-Glu  92.96 
 
 		 73 bp  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37130  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179999  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0077  tRNA-Glu  92.75 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0061  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0039  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0052  tRNA-Glu  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0041  tRNA-Glu  91.55 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0007  tRNA-Glu  91.55 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183145  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0053  tRNA-Glu  91.55 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.526279 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0059  tRNA-Glu  91.55 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.872199  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGluVIMSS1309264  tRNA-Glu  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0060  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.790027  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0026  tRNA-Glu  93.44 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.307498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0002  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.509318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0007  tRNA-Glu  92.75 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0026  tRNA-Glu  93.44 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.062518  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0062  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216976  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0059  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0079  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0106  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00248374  normal  0.1959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0036  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000509558  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0082  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277046  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0043  tRNA-Glu  90.28 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000194529  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0046  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113543  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0045  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0637715  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0112  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000133655  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0109  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000218236  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0078  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000635495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0039  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00037327  normal  0.202032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0040  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115197  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0044  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369113  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0107  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000800157  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0010  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.644532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0073  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000527545  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0113  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000136278  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0105  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00614062  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0038  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000255678  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGluVIMSS1309378  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0011  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.267714  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0024  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0080  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000364712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0043  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0177795  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGluVIMSS1309151  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0730688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0108  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000221581  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGluVIMSS1309208  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.689492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGluVIMSS1309126  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0104  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0156595  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0111  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000137608  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0074  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000046104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0072  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000259101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0110  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000208441  normal  0.204301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0077  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0084  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000679544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0083  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000720512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0081  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000920417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0076  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0037  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000218875  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0075  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000263239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0042  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353157  normal  0.196649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0041  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00117602  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGluVIMSS1309075  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0031  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0033  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.752576  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0048  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.849322 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0002  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240355  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0034  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0633103 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0056  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0031  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0288989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0007  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866877  hitchhiker  0.000537745 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  91.8 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0056  tRNA-Glu  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>