18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0011 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0011  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.638605 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0052  tRNA-Glu  96 
 
 
78 bp  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0012  tRNA-Glu  90.67 
 
 
78 bp  93.7  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0035  tRNA-Glu  93.55 
 
 
75 bp  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0016  tRNA-Glu  97.87 
 
 
73 bp  85.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0206825  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0035  tRNA-Asp  91.07 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0012  tRNA-Asp  91.07 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.326071  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0010  tRNA-Asp  91.07 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.330224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0039  tRNA-Asp  91.07 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.914328  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0037  tRNA-Asp  91.07 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0040  tRNA-Asp  91.07 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0037  tRNA-Asp  91.07 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0033  tRNA-Asp  91.07 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0024  tRNA-Asp  91.07 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0232255  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0022  tRNA-Asp  91.07 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0421287  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0027  tRNA-Glu  87.1 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.024041 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0063  tRNA-Glu  86.44 
 
 
75 bp  54  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0632745  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0052  tRNA-Glu  88 
 
 
73 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.914226  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>