21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_R0012 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_R0012  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.326071  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0037  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0010  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.330224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0039  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0033  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0035  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0024  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 78 bp  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0232255  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0022  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0421287  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0040  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0037  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0011  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.638605 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0052  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0012  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0016  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0206825  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0040  tRNA-Asp  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0043  tRNA-OTHER  93.75 
 
 		 68 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0018  tRNA-OTHER  93.75 
 
 		 98 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.352421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0030  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0016  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0046  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0019  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>