25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0035 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0035  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0063  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0632745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0027  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.024041 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0052  tRNA-Glu  95.16 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0011  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.638605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0016  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0206825  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0033  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84722 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0052  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.914226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0017  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0016  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0012  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0017  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0036  tRNA-Glu  84 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0016  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0030  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0038  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0052  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00190708  normal  0.716322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0039  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0033  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0051  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0674912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0970246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0027  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0770393  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0034  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>