20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0033 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0033  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84722 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0027  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.024041 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0035  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0063  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0632745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0019  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481461  hitchhiker  0.000000177152 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0036  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0052  tRNA-Glu  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.914226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0009  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.39439  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0058  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0068  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0012  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188086  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0017  tRNA-Glu  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0016  tRNA-Glu  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0011  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0070  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0071  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0027  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0395147  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0035  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0009  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0053  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>