62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_R0040 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_R0027  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0770393  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0039  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0038  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0970246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0050  tRNA-Ala  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0674912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0051  tRNA-Ala  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0052  tRNA-Ala  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00190708  normal  0.716322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0033  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11600  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.589046 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0034  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18170  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0037  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.822608  normal  0.125193 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1394  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0036  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.126613 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0073  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0041  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.910553  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0043  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0050  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0531103 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10290  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10200  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.24537  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0017  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000513914  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0016  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14015  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00298492  normal  0.41958 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0054  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.243452  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0045  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0023  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265478  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0024  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.831109  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0042  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.23769  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13160  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.10655  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0042  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23850  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0049  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30530  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.601239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0047  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0015  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07860  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0019  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.23026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0023  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.20757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0049  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0017  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0047  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000513142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0011  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00874285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0047  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0047  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00129328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_265  tRNA-Ala  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177438  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0005  tRNA-Ala  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0012  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0045  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0695113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0033  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0018  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245872  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0038  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0011  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0052  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0052  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0011  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0019  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14037  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.897629 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309124  tRNA-Ala  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127335  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0035  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>