55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_R0049 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_R0049  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0009  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0018  tRNA-Ala  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0012  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.556924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0036  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.126613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0013  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0016  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0053  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0010  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.319712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0064  tRNA-Ala  94.55 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0296327  normal  0.0688204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0044  tRNA-Ala  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.695473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0045  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0695113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0037  tRNA-Ala  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.822608  normal  0.125193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0075  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14015  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00298492  normal  0.41958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0027  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0770393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0028  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0970246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0052  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00190708  normal  0.716322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0051  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0050  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0674912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0040  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0043  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0039  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0038  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0023  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265478  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1394  tRNA-Ala  86.67 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0042  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.23769  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0045  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0042  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13160  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.10655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0055  tRNA-Ala  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.105758  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30530  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.601239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07860  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0011  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162478  normal  0.385967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0014  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0041  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.910553  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0019  tRNA-Ala  85.33 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.23026 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0054  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.243452  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0034  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31263  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23850  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11600  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.589046 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0003  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.308325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0047  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0033  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0049  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0015  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0052  tRNA-Ala  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0050  tRNA-Ala  83.78 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0531103 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0073  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0012  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0041  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0027  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.024041 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0188  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.320411  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t02  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>