60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_R0010 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.319712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0018  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0016  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0013  tRNA-Ala  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0012  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.556924 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0009  tRNA-Ala  94.59 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0044  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.695473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0049  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0053  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0045  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0695113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0075  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0064  tRNA-Ala  93.1 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0296327  normal  0.0688204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0036  tRNA-Ala  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.126613 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0014  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0041  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.910553  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0043  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0019  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0055  tRNA-Ala  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.105758  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14015  tRNA-Ala  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00298492  normal  0.41958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0001  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0063  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305975  normal  0.0658798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0037  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0066  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.645419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0067  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.750062  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0064  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713183  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32630  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.319038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0049  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.241293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0009  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0003  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.308325  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0017  tRNA-Ala  84.42 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0052  tRNA-Ala  84.42 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t02  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143246  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0011  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00874285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0011  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162478  normal  0.385967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0041  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0030  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0012  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142147 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0188  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.320411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0023  tRNA-Ala  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0056  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0004  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155888  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0019  tRNA-Ala  84 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.23026 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0013  tRNA-Val  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.05432  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0009  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4592  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0009  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31634  normal  0.278604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0009  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0051  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000860706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0014  tRNA-Val  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0864  hypothetical protein  91.43 
 
 		 276 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0047  tRNA-Ala  83.78 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0056  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.764712  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0051  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0870511  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0038  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.559626  normal  0.321441 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0049  tRNA-Ile  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R40  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.681358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA40  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82087  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t33  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>