94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_R0014 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0864  hypothetical protein  100 
 
 		 276 bp  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0014  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0074  tRNA-Val  97.22 
 
 		 75 bp  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0744587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0013  tRNA-Val  97.22 
 
 		 75 bp  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0013  tRNA-Val  97.22 
 
 		 75 bp  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688167  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0059  tRNA-Val  97.22 
 
 		 75 bp  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.40098  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0026  tRNA-Val  94.2 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0028  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.163089  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0046  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.052544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0002  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884588  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0019  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0039  tRNA-Val  91.3 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.910644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0044  tRNA-Val  91.3 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.306747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0073  tRNA-Val  91.3 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0045  tRNA-Val  91.3 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.374674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0043  tRNA-Val  91.3 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0048  tRNA-Val  91.3 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0187429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt01  tRNA-Val  91.3 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4574  tRNA-Val  91.3 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0200099  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0008  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0030  tRNA-Val  94.64 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0052  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0013  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0611  tRNA-Val  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0857734  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0049  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0046  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0052    88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0056  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0046  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0020  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0027  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.480715 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0050  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0953  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0058  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0053  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.694322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0105  tRNA-Val  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0047  tRNA-Val  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA13  tRNA-Val  87.14 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00601929  normal  0.184013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6005  tRNA-Val  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.859444 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t15  tRNA-Val  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0001  tRNA-Val  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.709613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0062  tRNA-Val  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0007  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0174963 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0012  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207104  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0061  tRNA-Val  87.3 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0041  tRNA-Val  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0007  tRNA-Val  96.97 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0014  tRNA-Val  96.97 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0047  tRNA-Val  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0047  tRNA-Val  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00873766  hitchhiker  0.00896999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0043  tRNA-Val  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0177605  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0040  tRNA-Val  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288253  hitchhiker  0.000507453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0063  tRNA-Val  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00355332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0005  tRNA-Val  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0039  tRNA-Val  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00107403  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1830  tRNA-Val  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.367633  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0168  tRNA-Val  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0024  tRNA-Val  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0007  tRNA-Val  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0005  tRNA-Val  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0051  tRNA-Val  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000163002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2440  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2943  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2946  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.411322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2949  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116038  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2150  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2626  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.888803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2629  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.8453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2632  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.602317  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0001  tRNA-Val  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000456569  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0020  tRNA-Val  85 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0332381  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0032  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0016  tRNA-Val  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000321371  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03462  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000504437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0033  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0035  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000268717  normal  0.222107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0024  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198375  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0010  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.319712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0028  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118191  normal  0.542965 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0001  tRNA-Val  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.613575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0026  tRNA-Val  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408746  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0037  tRNA-Val  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  normal  0.0810888 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0024  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0197077  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0042  tRNA-Val  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153066  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0030  tRNA-Val  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0035  tRNA-Val  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.491254  normal  0.639036 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0022  tRNA-Val  83.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0121384  normal  0.0431401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14900  tRNA-Val  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0029  tRNA-Val  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742373  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0032  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0044  tRNA-Val  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>