101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_R0053 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_R0053  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0009  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0018  tRNA-Ala  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0016  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0049  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0075  tRNA-Ala  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0010  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.319712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0013  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0012  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.556924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0044  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.695473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30530  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.601239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0043  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0064  tRNA-Ala  94.34 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0296327  normal  0.0688204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0045  tRNA-Ala  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0695113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0053  tRNA-Ala  89.19 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000600525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0036  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.126613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0047  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0019  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.23026 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14015  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00298492  normal  0.41958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18170  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0052  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0045  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0042  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.23769  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0042  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0024  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.831109  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19780  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0023  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265478  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0014  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.05432  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0029  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1441  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000019523  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0027  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.719402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0007  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0015  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0049  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0018  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.471036  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0019  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0014  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.267148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0052  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00062  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0002  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0004  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000393504  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0055  tRNA-Ala  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.105758  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0041  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.910553  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4705  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5079  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0002  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3866  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3912  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.303473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3956  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0473584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3834  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0179595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3847  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.779981  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4016  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4915  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0023  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.20757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0096  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0096  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.859581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0019  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07860  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11600  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.589046 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23850  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0003  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10591  normal  0.264536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0037  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.822608  normal  0.125193 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0031  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 69 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0833081  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1359  tRNA-Ala  89.8 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0031  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.057517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0003  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.308325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0050  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0051  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0009  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.152729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0012  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0011  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0011  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14037  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.897629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0011  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162478  normal  0.385967 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0050  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0531103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0104  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0052  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353851  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1369  tRNA-Pro  84.13 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0013  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.466573  normal  0.290235 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0051  tRNA-Pro  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0997799  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0038  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371322  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0017  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0061005  normal  0.238616 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1165  hypothetical protein  96.15 
 
 		 396 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.360814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0029  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0030  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0025  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.452658 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0011  tRNA-Ala  83.78 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0025  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0012  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0290089 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0033  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0038  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882256  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4158  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0016  tRNA-Ala  83.78 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00136922  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0017  tRNA-Ala  83.78 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000513914  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0017  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00199817  normal  0.0150591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32630  tRNA-Ala  83.78 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.319038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1394  tRNA-Ala  83.78 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>