20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_R0104 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_R0104  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna086  tRNA-Ala  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000772007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01010  tRNA-Ala  96.88 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0017  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2834  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000118902  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00199817  normal  0.0150591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3137t  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00236079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0053  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0065  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.485715 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0111  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000942112  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0104  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000207184  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0096  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000883074  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0094  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000040365  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0031  tRNA-OTHER  100 
 
 		 69 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0833081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0049  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00105958  hitchhiker  0.000875041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0045  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0202623  normal  0.372348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18170  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>