More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3137t on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3137t  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00236079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2834  tRNA-Ala  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000118902  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0096  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000883074  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0111  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000942112  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0094  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000040365  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01010  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0104  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000207184  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna086  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000772007  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2459  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0022  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0030  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000491237  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0076  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0810771  normal  0.223627 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0017  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0159  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0561625  normal  0.0478806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00039  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000221447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00040  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000022346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0009  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192071  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2645  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0670079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0097  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.636111  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0035  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057464  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0036  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0026  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0505593  unclonable  0.00000400099 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0156  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223913  hitchhiker  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_003295  RS04529  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000000942406  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_003295  RS04531  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000151858  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t004  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t063  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t095  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2547  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.03374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0012  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133641  hitchhiker  0.000473278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0027  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.00000000000168426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0030  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000620846  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3112t  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.885496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0036  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000477203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0043  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0457533  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0051  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000604865  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0044  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000111435  normal  0.0314224 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3076t  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00255258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2670  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0009  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0330321  hitchhiker  0.00801031 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0052  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00660859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0148  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00584205  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0014  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000183317  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0029  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000636082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0032  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000439194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0009  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331872  normal  0.306257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0008  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000976028  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0062  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0073  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0694926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0009  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.441626  hitchhiker  0.00992497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0022  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000187329  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0066  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000458923  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0073  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0105913  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2554  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000251345  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2775  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.466623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2555  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000235232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00468  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2603  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4679  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870415  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2776  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.453071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0009  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00140514  normal  0.720887 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06829  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2008  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0071  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000469836  normal  0.108632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0134  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000329737  normal  0.0145655 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3088t  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00271929  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0011  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000768002  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5048  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000423557  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5047  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000162268  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0092  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.892072  normal  0.128947 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0087  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00553547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0089  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0027987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0091  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000134168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0093  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000010191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0098  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000110088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0174  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.17996  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0040  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00260551  hitchhiker  0.00377232 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0041  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00270764  hitchhiker  0.00379847 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna156  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2546  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0594848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1300  hypothetical protein  89.04 
 
 		 147 bp  81.8  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00987773  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1301  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00804048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2968  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00156309  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0065  tRNA-Ala  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.485715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0010  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0312257  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0071  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.116303  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2604  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0335338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0080  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00215161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0136  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00216057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0021  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0879619  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0064  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.478576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0113  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000340482  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0003  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0369112  normal  0.119668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4680  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267016  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2646  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0083  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00420307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0116  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000551315  hitchhiker  0.000206689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0037  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0515316  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2669  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0059  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00107174  normal  0.0900334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>