92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_R0031 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_R0031  tRNA-OTHER  100 
 
 		 69 bp  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0833081  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10290  tRNA-Ala  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10200  tRNA-Ala  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.24537  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11600  tRNA-Ala  93.02 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.589046 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0073  tRNA-Ala  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309124  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127335  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.435087  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAlaVIMSS1309191  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0050  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0531103 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13041  hypothetical protein  91.3 
 
 		 165 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0021  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.584667  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAlaVIMSS1309346  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.190165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18170  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251001  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0010  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0605022 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0022  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331538  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAlaVIMSS1309149  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0382478  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309258  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0043  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0039  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000377805  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0044  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0002  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0024  tRNA-Ala  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.746229  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11500  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.931498  hitchhiker  0.0025263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0042  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0324793  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0041  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00164455  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t01  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126488  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0054  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876029  normal  0.742043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0040  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000987892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0056  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000771632  normal  0.557555 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0058  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000693286  normal  0.541415 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0030  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0063  tRNA-Ala  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0032  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0020  tRNA-OTHER  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0013  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0927028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0039  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000954288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0047  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.055133  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t39  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304224  normal  0.0192594 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0021  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000859233  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6047  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0049  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0051  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0033  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.106425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0031  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0725806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0029  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0737058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0075  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t41  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0706595  normal  0.0191352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t29  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t31  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA36  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA38  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851121  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0009  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R34  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t37  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295961  normal  0.0193801 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0018  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00619278  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0008  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.224087 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0455  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.654471  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0073  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0071  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0062  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0019  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0053  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0034  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0064  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0029  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0049  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00105958  hitchhiker  0.000875041 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0072  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665456  hitchhiker  0.000486615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0030  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.546773  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0040  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0036  tRNA-Ala  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.126613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0002  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0018  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245872  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0104  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0047  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000513142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0020  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.342024  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0047  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0028  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0041  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.910553  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0018  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000012168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0050  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00215399  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0028  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.139647  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00199817  normal  0.0150591 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0058  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72699  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14015  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00298492  normal  0.41958 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19780  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0011  tRNA-Ala  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAlaVIMSS1309073  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23850  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0023  tRNA-Ala  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0933742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>