145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_R0045 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_R0045  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0202623  normal  0.372348 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0019  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.495919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0045  tRNA-Ala  86.67 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0148496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t18  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000569276  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0049  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0040  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.403518  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0045  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.215104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0048  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000617749  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0028  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0050  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00234368 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19780  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0023  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0933742 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0040  tRNA-Ala  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0059  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00134196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0005  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000781338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0005  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0005  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000213903  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0020  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.342024  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0058  tRNA-Ala  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000131227  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0054  tRNA-Ala  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0054  tRNA-Ala  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t02  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0460294  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t04  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0049  tRNA-Ala  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00105958  hitchhiker  0.000875041 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057492  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0046  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0258027  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0051  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00326143  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0056  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000109894  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0024  tRNA-Ala  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.746229  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0013  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.466573  normal  0.290235 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0005  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0049  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0003  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10591  normal  0.264536 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0005  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314904 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.407573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt08  tRNA-Trp  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0600  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 155 bp  48.1  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0071  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0012  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.453962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0013  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0558  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0653  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2173  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.206805  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1579  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1614  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.614815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0086  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0087  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.456673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0055  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0053  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0013  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0053  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt07  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1180  tRNA-His  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0486597  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0024  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.226382 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0003  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194068  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0043  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.168441 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0010    100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0061  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0004  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87354  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0040  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000987892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0042  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0324793  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0039  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000377805  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0029  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0001  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.317875 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0055  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.429653  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106055  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0780  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0066  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0012  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.556924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0004  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000467453  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07860  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0008  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11500  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.931498  hitchhiker  0.0025263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0018  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0034  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0024  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0513079  normal  0.0822936 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0035  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0020  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0043  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0024  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.831109  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0013  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0641793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0338  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12303  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0018  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.916069 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0120  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0048  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.780393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0021  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0013  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635468  normal  0.0154478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0017  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0047  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.479856  normal  0.63722 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>